I runda - 7 sierpnia 2016 r g.17:00
Uczestniczą drużyny zgłoszone z Klasy B i C sezonu 2015-2016:
| Armatura Kraków |
| Bieżanowianka Kraków |
| Ekler Baranówka |
| Fitball Szklary |
| Gwiazda Ściejowice |
| Jastrzębiec Książ Wielki |
| Novi Narama |
| Orlęta Rudawa |
| Orzeł II Iwanowice |
| Płomień Kostrze |
| Polonia Nowa Huta˟ |
| Radziszowianka II Radziszów |
| Skała 2004 |
| Sparta Przeginia Duchowna |
| Spartak Charsznica |
| Topór Aleksandrowice |
| Trzebol Wielkie Drogi |
| Tytan Polekarcice |
| Wisła Rząska |
oraz 29 drużyn, które w sezonie 2015-2016 zajęły pozycje 4-14 w rozgrywkach Klasy A:
| Cedronka Wola Radziszowska |
| Dragon Szczyglice |
| Galicja Raciborowice |
| Górzanka Nawojowa Góra |
| Iskra Czułów |
| Iskra Krzęcin |
| Juvenia Prandocin |
| Libertów |
| Liszczanka Liszki |
| Lot Balice |
| Maszycanka Maszyce |
| Nadwiślan Rusocice |
| Orzeł 1948 Bębło |
| Partyzyant Dojazdów |
| Pogoń Wronin |
| Pozowianka Pozowice |
| Prądniczanka II Kraków |
| Radziszowianka Radziszów |
| Rybitwy Kraków |
| Słomniczanka Słomniki |
| Sportowiec Modlniczka |
| Strażak-Goszcza |
| Szreniawa 2010 Koszyce |
| Tramwaj Kraków |
| Wanda Kraków |
| Wierzbowianka Wierzbno |
| Wiślanie II Jaśkowice |
| Zelków |
| Zwierzyniecki Kraków |
oprócz:
| Niedźwiedź |
| Krakus Swoszowice |
| Rzozovia Rzozów |
| Bratniak Kraków |
które zrezygnowały z uczestnictwa w obecnej edycji Pucharu Polski.
II runda - 14 sierpnia 2016 r. g. 17:00
Uczestniczą drużyny:
24 zwycięzców z I rundy
oraz 6 drużyn, które w sezonie 2015-2016 zajęły pozycje 2 i 3 w rozgrywkach Klasy A:
| Bibiczanka Bibice |
| Czarni 03 Grzegorzowice |
| Dąbski Kraków |
| Gajowianka Gaj |
| Strażak Rączna |
| Wieczysta Kraków |
III runda - 31 sierpnia 2016 r. g.17:00
Uczestniczą drużyny:
15 zwycięzców z II rundy
oraz 2 drużyny, które awansowały w sezonie 2015-2016 do rozgrywek Klasy Okręgowej (Iskra Radwanowice zrezygnowała z udziału w obecnej edycji Pucharu Polski)
| Błękitni Modlnica |
| Wisła Jeziorzany |
a także 19 drużyn, które uczestniczyły w rozgrywkach Klasy Okręgowej w sezonie 2015-2016:
| AP Kmita Zabierzów |
| Borek Kraków |
| Bronowianka Kraków |
| Clepardia Kraków |
| Garbatnia II Kraków |
| Grębałowianka Kraków |
| Kaszowianka Kaszów |
| Lotnik Kryspinów |
| Nadwiślan Kraków |
| Orzeł Iwanowice |
| Piast Wołowice |
| Podgórze Kraków |
| Prądniczanka Kraków |
| Prokocim Kraków |
| Sokół Kocmyrzów |
| Świt Krzeszowice |
| Tęcza Piekary |
| Węgrzce |
| Zieleńczanka Zielonki |
IV runda - 14 września 2016 r. g.16:30
Uczestnicza drużyny:
18 zwycięzców z III rundy
oraz 6 drużyn, które uczestniczyły w rozgrywkach IV ligi w sezonie 2015-2016:
| Jutrzenka Giebułtów |
| Michałowianka Michałowice |
| Nowa Proszowianka Proszowice |
| Orzeł Piaski Wielkie |
| Skawinka Skawina |
| Wiślanie Jaśkowice |
V runda - 28 września 2016 r. g.16:00
Uczestniczą drużyny:
12 żwycięzców IV rundy
oraz 4 drużyny, które uczestniczyły w rozgrywkach III ligi w sezonie 2015-2016:
| Cracovia II Kraków |
| Garbarnia Kraków |
| Hutnik Kraków |
| Wisła II Kraków |
Ćwierćfinały - 12 października 2016 r. g.15:30
Uczestniczą drużyny:
8 zwycięzców V rundy
Półfinały
Uczestniczą drużyny:
4 zwycięzców ćwierćfinałów
Finał
Uczestniczą drużyny:
2 zwycięzców półfinałów