W rozgrywkach o Puchar Polski obowiązkowo biorą udział drużyny III ligi, IV ligi, klasy okręgowej i A klasy sezonu 2016/2017. Klub A klasy (w sezonie 2016/2017) może wystąpić do Komisji Gier PPN Kraków o zwolnienie z udziału w rozgrywkach (forma pisemna) do dnia 10 lipca 2016 roku na e-mail: ppnkrakow@mzpnkrakow.pl
I runda - 5 sierpnia 2017 r.
II runda - 12 sierpnia 2017 r.
Kluby, które mają prawo uczestnictwa w Pucharze Polski na szczeblu PPN Kraków w sezonie 2017-2018 to:
IV Liga (stan na sezon 2016-2017)
| Cracovia II Kraków |
| Hutnik Kraków |
| Jutrzenka Giebułtów |
| Michałowianka Michałowice |
| Nowa Proszowianka Proszowice |
| Orzeł Piaski Wielkie |
| Skawinka Skawina |
| Węgrzce |
| Wiślanie Jaśkowice |
Klasa Okręgowa (stan na sezon 2016-2017)
| AP Kmita Zabierzów |
| Błękitni Modlnica |
| Borek Kraków |
| Bronowianka Kraków |
| Clepardia Kraków |
| Garbatnia II Kraków |
| Grębałowianka Kraków |
| Iskra Radwanowice |
| Kaszowianka Kaszów |
| Nadwiślan Kraków |
| Orzeł Iwanowice |
| Piast Wołowice |
| Podgórze Kraków |
| Prądniczanka Kraków |
| Prokocim Kraków |
| Sokół Kocmyrzów |
| Świt Krzeszowice |
| Tęcza Piekary |
| Wisła Jeziorzany |
| Zieleńczanka Zielonki |
Klasa A (stan na sezon 2016-2017)
| Radziszowianka Radziszów |
| Słomniczanka Słomniki |
| Wieczysta Kraków |
| Bibiczanka Bibice |
| Bieżanowianka Kraków |
| Cedronka Wola Radziszowska |
| Czarni 03 Grzegorzowice |
| Dragon Szczyglice |
| Gajowianka Gaj |
| Galicja Raciborowice |
| Iskra Krzęcin |
| Jastrzębiec Książ Wielki |
| Juvenia Prandocin |
| Libertów |
| Liszczanka Liszki |
| Lot Balice |
| Lotnik Kryspinów |
| Nadwiślan Rusocice |
| Orzeł 1948 Bębło |
| Partyzyant Dojazdów |
| Pogoń Wronin |
| Prądniczanka II Kraków |
| Skała 2004 |
| Sportowiec Modlniczka |
| Strażak-Goszcza |
| Strzelcy Kraków |
| Szreniawa 2010 Koszyce |
| Tramwaj Kraków |
| Tytan Polekarcice |
| Wierzbowianka Wierzbno |
| Wisła Czernichów |
| Wiślanie II Jaśkowice |
| Zelków |
| Zwierzyniecki Kraków |
Kluby zgłoszone z Klasy B i C (stan na sezon 2016-2017)
| Albertus Kraków |
| Armatura Kraków |
| Błękitni Czułówek |
| Borkowianka Borek Szlachecki |
| Ekler Baranówka |
| Gwiazda Ściejowice |
| Maszycanka Maszyce |
| Niegoszowianka Niegoszowice |
| Orlęta Rudawa |
| Orzeł 1948 II Bębło |
| Płomień Kostrze |
| Pozowianka Pozowice |
| Radziszowianka II Radziszów |
| Rybitwy Kraków |
| Rzozovia Rzozów |
| Słomniczanka II Słomniki |
| Sokół Rybna |
| Sparta Przeginia Duchowna-Narodowa |
| Topór Aleksandrowice |
| Trzebol Wielkie Drogi |
| Universum Kraków |
| Wanda Kraków |
| Wisła Rząska |